Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm21049-201ENSMUST00000197078 987 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 AC100590.1-201ENSMUST00000220318 1357 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.4 ms