Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfdn6Q03958 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfdn6Q03958 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfdn6Q03958 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pfdn6Q03958 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pfdn6Q03958 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pfdn6Q03958 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pfdn6Q03958 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pfdn6Q03958 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pfdn6Q03958 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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