Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnb1Q03717 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms