Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GscQ02591 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GscQ02591 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms