Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HmgcrQ01237 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms