Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms