Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms