Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
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