Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NficP70255 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NficP70255 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NficP70255 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms