Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms