Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rps29P62274 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms