Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp46P62069 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Usp46P62069 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Usp46P62069 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Usp46P62069 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Usp46P62069 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms