Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl27P61358 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms