Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sem1P60897 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms