Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms