Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp25P57080 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms