Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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