Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms