Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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