Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms