Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms