Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Tnfsf9P41274 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tnfsf9P41274 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tnfsf9P41274 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tnfsf9P41274 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tnfsf9P41274 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tnfsf9P41274 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tnfsf9P41274 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Tnfsf9P41274 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Tnfsf9P41274 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Tnfsf9P41274 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Tnfsf9P41274 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms