Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VhlP40338 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms