Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf2P39429 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Traf2P39429 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf2P39429 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms