Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtlP38585 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtlP38585 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtlP38585 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtlP38585 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtlP38585 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TtlP38585 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtlP38585 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtlP38585 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TtlP38585 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms