Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Apoc1P34928 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Apoc1P34928 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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