Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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