Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxraP28700 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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