Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm7714-201ENSMUST00000169154 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Prim1P20664 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms