Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18532 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18532 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms