Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18529 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18529 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P18529 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms