Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhoP15409 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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