Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms