Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtcP11725 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms