Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Olfr914-202ENSMUST00000217057 4948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Defa1P11477 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms