Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 2610020F03Rik-201ENSMUST00000180401 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Sh2d1a-207ENSMUST00000189753 1223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm21049-201ENSMUST00000197078 987 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Rpl31-201ENSMUST00000086535 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms