Protein–RNA interactions for Protein: P0CG50

Ubc, Polyubiquitin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbcP0CG50 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms