Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04224 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04224 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04224 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04224 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04224 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04224 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04224 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04224 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04224 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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