Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01655 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01655 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P01655 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01655 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01655 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01655 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P01655 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P01655 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P01655 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01655 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P01655 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01655 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01655 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01655 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P01655 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P01655 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01655 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01655 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01655 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01655 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01655 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01655 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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