Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms