Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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