Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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