Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kpna3O35344 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms