Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer4dL7N216 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms