Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem200cJ3QK46 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms