Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Cldn34c3J3QJW5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
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