Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms