Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd2E9PZM4 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms