Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms