Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms